Pour prendre la succession de Roberto De Zerbi, Habib Beye incarne le choix numéro 1 du directeur du football de l'Olympique de Marseille Medhi Benatia. Pour le consultant de la radio RMC Jérôme Rothen, le technicien sénégalais n'a pas la légitimité nécessaire pour diriger le club phocéen.
"Je vais peut-être être cash, mais Habib Beye en quoi il a la crédibilité d’entraîner l’OM ? C’est du copinage ! Ce copinage, il a été fait dans le recrutement de certains joueurs, de certaines personnes qui occupent des fonctions à l’OM. Ce n’est que ça, c’est un bordel sans nom ! (...) Jacques Abardonado, il a plus de crédibilité à entraîner l’OM que Beye sur le court terme, plutôt que de te précipiter à faire un choix hallucinant. Quand tu vois l’état du vestiaire de Rennes à son départ...", a soufflé l'ancien Parisien.