Après le départ de Didier Deschamps, André-Pierre Gignac (26 ans, 21 apparitions et 1 but en L1 en 2011-12) a retrouvé à Marseille un technicien avec lequel il avait parfois eu aussi une relation difficile à Toulouse, Elie Baup. Mais l'attaquant olympien l'assure, tout va très bien avec le nouvel entraîneur du club phocéen.
"Il n'y a pas de hache de guerre. Pourquoi voulez-vous que je m'embrouille avec tous les coachs ? Je m'embrouille avec Deschamps, je m'embrouille avec Baup, non. Il n'y a pas d'embrouille. C'est lui qui m'a recruté, comme Didier Deschamps à l'OM. Elmander a fait le boulot, j'avais 21 ans, je n'étais pas encore un attaquant confirmé. J'avais joué 28 matchs. Je ne vois pas où est le problème entre Elie Baup et moi, et je vous assure qu'il n'y en a pas et que cela se passe très bien", a indiqué l'ancien Toulousain après le match nul de l'OM contre Sion dimanche soir (1-1).
Chez les Violets, Baup lui préférait souvent le Suédois Johan Elmander.