A l'issue de la 6e et dernière journée de la phase de poules de la Ligue Europa, les 24 qualifiés pour les 16es de finale sont désormais connus, soit les premiers et deuxièmes de chaque groupe. Ils seront rejoints par les huit clubs qui ont terminé à la 3e place de leur groupe en Ligue des Champions. A noter que les troisièmes et quatrièmes de la phase de poules de la C3 sont éliminés.
Premiers : Liverpool, Plzen, Fenerbahçe, Bordeaux, Steaua Bucarest, Dnipropetrovsk, Genk, Rubin Kazan, Lyon, Lazio Rome, Metalist, Hanovre.
Deuxièmes : Anzhi Makhachkala, Atletico Madrid, M'Gladbach, Newcastle, Stuttgart, Naples, Bale, Inter Milan, Sparta Prague, Tottenham, Bayer Leverkusen, Levante.
Troisièmes : Young Boys Berne, Coimbra, Marseille, Maritimo, Copenhague, PSV Eindhoven, Fehervar, Partizan, Athletic Bilbao, Panathinaïkos, Rosenborg, Helsingborg.
Quatrièmes : Udinese, Hapoel Tel Aviv, Limassol, Bruges, Molde, Solna, Sporting Lisbonne, Neftchi, Kiryat Shmona, Maribor, Rapid Vienne, Twente.
Reversés de la Ligue des Champions : Dynamo Kiev, Olympiakos Le Pirée, Zénith Saint-Pétersbourg, Ajax Amsterdam, Chelsea, BATE Borisov, Benfica Lisbonne, CFR Cluj.
Le tirage au sort des 16es de finale de la Ligue Europa aura lieu le jeudi 20 décembre. Les matchs aller se dérouleront le 14 février, et les matchs retour le 21 février.